En la aplicación de correo IOS: haga clic en Editar y debería haber una opción "Marcar todo". Se puede marcar, Marcar como leído o mover a Junk. La selección individual de correos en el modo de edición le permite eliminarlos ... aunque se debe seleccionar manualmente.
Si se trata de una cuenta de gmail, puede iniciar sesión con un navegador y seleccionar y eliminar el correo de forma masiva.
Si tengo acceso a la nube, vaya a enlace en el navegador. Piensa que necesitas estar en la PC, puedes seleccionar todo y eliminar desde allí.
Respuesta corta ... no es posible fácilmente en el iPad, pero hay varias soluciones según la cuenta.