Los últimos 4 días, encontré este problema dos veces. Estoy usando mi Retina Macbook Pro 13 "(OS X: El-Capitan) con una pantalla Thunderbolt (+ mouse y teclado de terceros conectados al TBD) desde hace aproximadamente dos semanas.
Intenté despertarlo abriendo la tapa, sin pantalla (absolutamente, ni siquiera una pantalla negra), no responde el teclado, intenté encenderlo con el botón de encendido, tuve que presionarlo (y sostenerlo) muchas veces antes de que respondiera (finalmente), mostrando un mensaje en varios idiomas como Your computer was shut down because of a problem , y cuando inicié sesión, apareció este cuadro de diálogo:
("apagar" en lugar de "reiniciar", esta imagen se encontró en la web)
Todo funciona bien después de la aparición de este problema SCARY.
Uso dos (famosos) software que requieren SIP deshabilitado: SwitchResX y Karabiner.
EDIT 1:
lo que syslog | grep shutdown tenía que decir sobre el problema:
Sep 29 17:54:40 localhost kernel[0] <Notice>: Previous shutdown cause: 3
Sep 29 17:54:40 localhost locationd[89] <Error>: locationd was started after an unclean shutdown