Combina archivos por nombre y zip

Puedes hacerlo fácilmente con un breve fragmento de bash.

p=SOME.CRAZY.STUFF
for i in *; do
    f="${i%.*}"
    if [[ "$p" != "$f" ]]; then
        zip "$f" "$f".*
    fi
    p="$f"
done

Si no está familiarizado con Terminal / bash y no planea usar esto con demasiada frecuencia, puede hacer lo siguiente para usarlo:

• crea una carpeta donde muevas todos tus reyes y reinas a (y nada más)
• abra Terminal, escriba cd seguido de un espacio, arrastre la carpeta que acaba de crear a la ventana de Terminal (suelte el botón del mouse una vez que aparezca una cruz verde) y presione Enter
• escriba p=SOME.CRAZY.STUFF seguido de Ingresar

• tipo (o incluso mejor copiar / pegar)

  for i in *; do f="${i%.*}"; if [[ "$p" != "$f" ]]; then zip "$f" "$f".*; fi; p="$f"; done
  

  de nuevo seguido de Enter

• (suponiendo que no se muestre ningún mensaje de error, etc.) salga de Terminal otra vez

puedes poner ambos en una carpeta y comprimir esa carpeta ...

de lo contrario, necesitas usar tar, que es un poco más complicado ...