La forma más fácil (y gratuita) sería actualizar su sistema a OSX 10.9 (Mavericks); de hecho, incorporaron esto en la versión más nueva de Safari que se incluye.
Si no quiere aventurarse en esa ruta, hay algunas extensiones de Safari que puede usar para lograr su objetivo.
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ClickToPlugin y / o ClickToFlash
enlace
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Extensión de YouTube5: los bloquea al no admitirlos
enlace
3: AdBlock Plus: siga la página de compilaciones de desarrollo (el segundo enlace) para ver cuándo lanzan su versión para Safari. Sé que ahora está retrasado pero aún está en desarrollo.
Tendrás que buscar en Google ya que no tengo suficiente representante para publicar más de 2 enlaces, lo siento.
Personalmente ejecuto Mavericks, pero también uso ClickToPlugin; funciona para cualquier anuncio que la versión más reciente de Safari no detecte.