¿Cómo desinstalo manualmente las Herramientas del desarrollador?

Sí, simplemente ejecuta lo siguiente en la Terminal:

sudo <Xcode>/Library/uninstall-devtools --mode=all

Donde <Xcode> es la instalación predeterminada de Xcode, normalmente:

sudo /Developer/Library/uninstall-devtools --mode=all

Según su OP, asumo que está ejecutando Xcode pre-Lion. Esto se trata en la documentación que viene con la instalación de las Herramientas para desarrolladores:
/Developer/About Xcode

  

Desinstalación de Xcode Developer Tools
  Para desinstalar las herramientas de desarrollador de Xcode en el volumen de arranque junto con el directorio, desde un tipo de ventana de Terminal:
  $ sudo / Library / uninstall-devtools --mode = all

     

Para eliminar el contenido del desarrollador subyacente en el volumen de inicio, pero deje el directorio y los archivos de soporte sin tocar, desde un tipo de ventana de Terminal:   $ sudo / Library / uninstall-devtools - mode = systemsupport   Para eliminar simplemente el soporte de desarrollo de UNIX en el volumen de arranque, pero deje el directorio y los archivos de soporte sin tocar, desde una ventana de Terminal tipo:
  $ sudo / Library / uninstall-devtools --mode = unixdev

     

Finalmente, para simplemente desinstalar el directorio, simplemente puede arrastrarlo a la papelera, o desde un tipo de ventana de Terminal:
  $ sudo / Library / uninstall-devtools --mode = xcodedir

     

NOTA: el desinstalador que se incluye con las versiones anteriores de las herramientas para desarrolladores de Xcode no limpiará todo el sistema correctamente. Deberías usar el que está instalado con estas herramientas de desarrollo de Xcode.

Por favor, compruebe que esta documentación exista con su instalación o sea la misma que su instalación antes de actuar. Al igual que con cualquiera de estos comandos, la precisión y la compatibilidad son fundamentales .

Parece que solo tienes que eliminar la carpeta /Developer (especialmente si ya has instalado la versión 4.3 o posterior de Xcode). La sección Xcode del Centro de asistencia para desarrolladores de Apple en realidad te dice que hagas esto (énfasis mío).

  

He instalado la última versión de Xcode de la Mac App Store, pero una versión anterior de Xcode (4.2.1 o anterior) sigue iniciándose. ¿Qué debo hacer?

     

Para ejecutar la última versión de Xcode, asegúrese de que está ejecutando Xcode.app desde la carpeta Aplicaciones. Xcode 4.3 y versiones posteriores se empaquetan en la Mac App Store como una sola aplicación y se instalan en su carpeta de Aplicaciones como Xcode.app.

     

Las versiones anteriores de Xcode colocaron las herramientas y los marcos en la carpeta Desarrollador. Puede eliminar la versión anterior de Xcode arrastrando la carpeta del desarrollador a la papelera.

Esto se reitera en Nuevas características en Xcode 4.3 (énfasis mío).

  

La simplificación proporcionada por el reenvasado de Xcode 4.3 como un solo paquete de aplicaciones elimina la necesidad del directorio /Developer que contiene versiones anteriores de Xcode. Como resultado, la aplicación Instalar Xcode y la Las secuencias de comandos de la línea de comando de uninstall-devtools tampoco son necesarias.

     

Nota: La primera vez que ejecute Xcode 4.3, se le pedirá un cuadro de diálogo para eliminar la aplicación Instalar Xcode del directorio de aplicaciones, si hay alguna, y para eliminar cualquier instalación anterior de Xcode ( Figura 4). Estas acciones son opcionales, Xcode 4.3 puede coexistir con instalaciones anteriores de Xcode en la misma Mac. Algunas operaciones pueden requerir una contraseña de administrador para habilitarlas si cambia de una versión de Xcode a otra.

     

Figura 4 Opción para eliminar versiones anteriores de Xcode

     

     

Si elige no eliminar estos elementos en el primer lanzamiento de Xcode 4.3, puede eliminar la carpeta /Developer y la aplicación Instalar Xcode arrastrándolos a la Papelera en cualquier momento.