Sin saber más detalles, no puedo saberlo con certeza, pero parece probable que la esposa de su padre reciba los mensajes de iMensage que se le enviaron, pero no los mensajes de texto SMS. Este es el comportamiento diseñado: los iMessages se entregan a un ID de Apple, y si comparten un ID de Apple, los iMessages irán a ambos. La solución es para ellos no compartir una ID de Apple.
Dicho esto, uno puede configurar un ID de Apple diferente para los mensajes pero mantener el mismo ID de Apple para la tienda de aplicaciones, iTunes, etc. Esto les permitiría compartir compras, pero mantener sus mensajes separados unos de otros.
También puedes acceder a Configuración > Mensajes > Enviar & Recibir y desmarcar marca la dirección de correo electrónico que está asociada con sus dos teléfonos (y las ID de Apple). Existe una buena posibilidad de que también solucione su problema.