Sé que llego bastante tarde, pero yo también tenía este problema, así que pensé que daría la solución.
Una sugerencia: no uses el movimiento de dos dedos integrado de Chrome. Estoy en Chrome 24 en este momento, por lo que tuvieron una gran oportunidad de solucionar el problema desde que lo informaste. Pero no lo han hecho.
El problema en realidad es que las páginas web que son más largas que la ventana gráfica y que tienen contenido para desplazarse hacia abajo no funcionarán con el deslizamiento de dos dedos, la página simplemente se deslizará hacia arriba o hacia abajo según la dirección en la que se encuentre empujando hacia adentro.
La solución: use BetterTouchTool para definir sus propios movimientos de dos dedos para Chrome. Hice eso y comenzó a trabajar instantáneamente para Chrome. Funciona en todas las páginas, independientemente de si tienen desplazamiento o no. He probado en muchas páginas pf.
Sé que esto no será tan 'sexy' como el golpe incorporado de Chrome, pero funciona. También dependerás de BTT, pero lo uso en tantas aplicaciones que permanece en todo momento.
Uso BTT para deslizar tres dedos en el Finder para ir hacia adelante y hacia atrás y también para presionar con cuatro dedos para cerrar una ventana (esto funciona a nivel mundial).
Todo lo mejor!