No sé por qué, pero hace aproximadamente una semana comencé a ver muchos errores como este en system.log:
9/15/12 5:55:21.769 AM Alfred[263]: DB Query: select item, count(item) as used from knowledge where ts > ? and item in (?,?,?,?,?,?,?,?,?,?,?,?,?,?,?,?,?,?,?) group by item
9/15/12 5:55:21.769 AM Alfred[263]: DB Error: 11 "database disk image is malformed"
Ocasionalmente tomaría aproximadamente un segundo para que los archivos se muestren en la lista de resultados.
La eliminación del índice de Spotlight no ayudó, pero luego noté que la pestaña de uso tampoco mostraba ninguna estadística:
Creo que lo resolví simplemente presionando el botón de restablecer el conocimiento. Pero no encontré resultados de búsqueda para este problema, así que estoy respondiendo esta pregunta yo mismo.