No pude abrir ningún archivo de aplicación java .jar después de instalar OS X El Capitan. El único mensaje después de abrir siempre es: No se pudo abrir el archivo Java-Jar "ABC.jar".
Instalé tanto jdk1.8.0_65.jdk como jdk1.8.0_66.jdk pero no funciona en absoluto. También ha instalado el JDK 1.6 heredado para OS X.