Tengo este problema y por lo que descubrí que hacen otras personas, mi puntero desaparece. Puedo ver cosas debajo de reaccionar al movimiento, pero el puntero se ha ido. Sucede raramente, pero es lo suficientemente confuso. Cmd + Tab to Finder soluciona el problema, pero al volver al navegador, el puntero desaparece nuevamente.
En su mayoría sucede en Safari y Chrome. No he visto ninguna solución que funcione.
Estoy usando OS X 10.8, pero este problema también existía antes.